108年：辦理都市計畫變更作業、完成土建細部設計標招標作業(7月)、啟動土建細部設計作業。
109年：完成都市計畫變更作業、完成土建細部設計作業(9月)、進行土建及機電系統工程招標作業。
110年：完成土建及機電系統工程招標作業、辦理土建及機電系統工程開工、用地取得及建築物拆遷。
111年：辦理土建工程施工作業、機電系統工程細部設計及製造作業、完成用地取得及建築物拆遷(7月)。
112~116年：辦理機電系統工程暨部設計及製造作業、土建工程施工作業。
117年：完成土建工程、實質完工、進行模擬演練及初、履勘。
118年：進行驗收、營運改善作業、進行營運後可靠度、可維修度驗證。
119年：完成驗收、竣工作業、完成營運後可靠度、可維修度驗證。

• 土建細部設計標
1.DQ125標：已於108年7月8日決標，決標金額為377,500,000元，得標廠商為中興工程顧問股份有限公司，並已於108年7月11日啟動設計作業，已於109年完成土建細部設計作業。
2.DQ126標：已於108年7月12日決標，決標金額為475,500,000元，得標廠商為中興工程顧問股份有限公司及林同棪工程顧問股份有限公司(T.Y.LIN)共同承攬，並已於108年7月26日啟動設計作業，已於110年完成設計作業。
• 土建施工區段標
1. CQ880區段標：拆分為CQ880A標及 CQ880B標。
(1)CQ880A標（土城地下段）：已於112年12月1日決標並於113年3月開工，得標廠商為遠揚營造股份有限公司及日商岩田地崎營造股份有限公司台灣分公司共同承攬，決標金額115億餘元，工程內容包含土建、水電環控及電梯電扶梯工程。
(2)CQ880B標（土城高架段）：工程內容包含土建及水電環控工程，113年3月29日公告招標，將於113年5月16日開標，招標預算約107餘億元。
2.CQ890標（樹林段）：已於111年決標並開工，決標金額180億餘元，工程內容包含土建及水電環控工程。

• 機電系統標
已於109年7月23日簽約，決標金額149億元，109年開工。

97年8月6日萬大線全線環境影響說明書定稿本獲行政院環保署同意備查。
環境影響差異分析報告 111年5月25日經環保署第420次會議審議通過，8月10日經環保署備查。

107年10月17日奉行政院核定。
刻正辦理財務修正計畫作業，112年5月19日第1次提報中央審議，8月23日第2次提報中央審議，10月23日交通部召開審查委員會，113年1月19日第3次提報中央審議，113年3月20日第4次依交通部審查意見及審議原則規定檢送交通部核轉行政院核定。

106年11月20日都市計畫變更案辦理公開展覽
108年3月28日都市計畫變更案經本市都市計畫委員會審議通過
108年5月10日提報內政部都市計畫委員會審議
109年12月8日內政部都市計畫委員會審議通過，除LG11站外，其餘依內政部都委員小組審查意見修正，110年3月19日細部計畫經本市都委會大會通過。
110年4月27日至110年5月26日重新公展30日。
111年2月10日「變更龍壽、迴龍地區案都市計畫(桃園市轄區)(部分道路用地為捷運系統用地兼供道路使用)(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)案計畫書」發布實施
111年2月22日「變更樹林都市計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG14、LG15、LG16、LG17、LG18)主要計畫」發布實施
111年4月8日「擬定樹林都市計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG14、LG15、LG16、LG17、LG18)細部計畫」案核定實施。
111年10月27日「變更龍壽、迴龍都市計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG21站)案」發布實施。
111年11月4日「變更土城(頂埔地區)都市計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(路線段)主要計畫案」發布實施。
111年11月29日「變更土城(頂埔地區)都市計畫(既有發展地區)細部計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(路線段)案」核定實施。
111年10月27日「變更樹林(三多里地區)主要計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG18、LG19、LG20站)案」發布實施。
111年11月29日「變更樹林(三多里地區)細部計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG18、LG20站)案」及「變更樹林(三多里地區)細部計畫(配合捷運萬大-中和-樹林線第二期路線)(LG19站)案」核定實施。
113年3月1日「變更土城都市計畫（配合捷運萬大 — 中和 — 樹林線第二期路線）（LG10、LG12站）主要計畫」及「變更土城細部計畫（配合捷運萬大 — 中和 — 樹林線第二期路線）（LG10、LG12站）」發布實施。

99年2月12日行政院核定走廊研究規劃報告，原則同意全線路線及場站規劃，採分期興建，並指定臺北市政府擔任地方主管機關，且要求地方主管機關整合沿線周邊土地開發效益，提高自償率並提出財務修正計畫再報中央核定。
「捷運萬大線第二期財務計畫暨期程調整修正報告書」已於107年10月17日奉行政院院臺交字第1070124436號函核定。