第二期路網因應地方民意調整路線，刻正辦理修正計畫，獲行政院核定後接續進入施工階段。
D年：修正計畫獲行政院核定通過。
D+1年：用地取得事宜、土建及機電細部設計、施工。
D+2年：用地取得事宜、土建及機電細部設計、施工。
D+3年：土建及機電細部設計、施工。
D+4年：土建及機電細部設計、施工。
D+5年：完工通車。

第二期工程發包及分標策略，研議比照一期採統包工程辦理發包，並分為土建標及機電標，其中土建工程辦理公開招標，機電系統工程採後續擴充辦理限制性招標。另辦理專案管理、系統獨立驗證與認證及監造等委託技術服務廠商評選，以協助督導工程推展。

環境影響說明書於101年12月7日行政院環保署同意備查。
「淡海輕軌運輸系統(原淡水捷運延伸線工程)環境影響說明書環境影響差異分析報告(藍海線二期計畫路線及站名調整、新增V26A車站、土方量及餘土收容單位調整)」於112年3月20日行政院環保署同意備查。

102年2月25日行政院核定綜合規劃報告。
刻正辦理修正計畫作業。
109年10月30日第1次提報，交通部於110年01月07日函復審查意見。
110年04月14日第2次提報，交通部於110年05月13日召開第1次初審會議。
110年09月14日第3次提報，交通部於110年11月10日召開第2次初審會議。
111年03月04日第4次提報，交通部於111年05月27日召開第3次初審會議。
111年11月30日第5次提報，交通部於112年04月18日函復審查意見。
112年06月08日第6次提報，交通部於112年09月08日召開審查委員會。
112年11月27日第7次提報，交通部於113年03月01日召開會議討論。
113年03月06日第8次提報，交通部於113年03月28日召開第2次審查委員會通過。
110年04月15日第9次提報，交通部於113年07月05日陳報行政院審議，並於113年09月12日函轉行政院審查意見。
113年10月24日第10次提報，交通部於114年02月13日函復審查意見。

「變更淡水都市計畫(配合淡海輕軌運輸系統第二期路網)」於112年5月19日辦理公開展覽30日，於5月30日召開公展說明會，於7月17日召開第1次專案小組會議，於8月2日辦理現勘及第2次專案小組會議，於12月20日召開第3次專案小組會議，目前於113年2月23日新北市都市計畫委員會第159次大會審議通過，於113年4月19日提報內政部審議，113年8月15日召開內政部都委會第1次專案小組會議，依專案小組審查意見修正後於113年11月1日再提報內政部續審，內政部於114年3月5日函請補正資料。

99年6月8日行政院核定可行性研究。